這篇整理常見的基因出現頻率比較、常見疾病與主題考點、很像的基因名稱系列、Repeat Expansion系列,算是比較雜亂的一篇,但又很常考,只好獨立成篇。
常見基因頻率與重要突變點
1. CMT(夏柯-馬利-杜斯氏症)
- 整體分型:CMT1A > CMTX
- 去髓鞘型(Demyelinating):PMP22 dup > GJB1 (Cx32) > MPZ > PMP22 pm
- 軸突型(Axonal):MFN (2A) > female GJB1 (X) > NEFL (2E) > MPZ (2I/2J)
2. Familial Brain Calcification(家族性腦鈣化)
- 體染色體顯性(AD):SLC20A2 (61%) > PDGFRB (12%) > PDGFB > XPR1
- 體染色體隱性(AR):MYORG (13%) > JAM2
3. TTR-FAP(轉甲狀腺素蛋白家族性澱粉樣多發性神經病變)
- 常見突變位點:
- 台灣:A97S >> I73V
- 非裔美籍:A122I
- A97S 最常見症狀:Sensory polyneuropathy、70% autonomic dysfunction、合併 Heart failure(心臟衰竭)、Neuropathic pain(60%)
4. bv-FTD(行為變異型額顳葉失智症)
- 病理 / 蛋白比例:TDP (50%) > Tau (40%) > FUS (10%)
5. Dystonia(肌張力不全,台灣)
- 基因常見順序:SGCE > TH > GCH1 = PRRT2 = CACNA1B > PLA2G6 = PINK1 > Parkin
6. Familial PD(家族性帕金森氏症)
- 最常見 AD:LRRK2
- 最常見 AR:PARKIN
7. ALS(肌萎縮性脊髓側索硬化症 / 漸凍症)
- 全球(Worldwide):
- Familial:C9ORF72 > SOD1 > TARDBP / FUS
- Sporadic:C9ORF72 > TARDBP / FUS / SOD1
- 台灣(Taiwan):
- Familial:SOD1 > TARDBP > C9ORF72 > FUS
| 疾病類別 | 盛行率 / 發生頻率順序 | 關鍵突變點與臨床特點 |
| CMT (整體) | CMT1A > CMTX | 整體以 CMT1A (PMP22 重複) 為最常見 |
| CMT (Demyelinating) | PMP22 dup > GJB1 (Cx32) > MPZ > PMP22 pm | – |
| CMT (Axonal) | MFN2 (2A) > 女性 GJB1 (X) > NEFL (2E) > MPZ (2I/2J) | – |
| 家族性腦鈣化 (FBC) | AD (常見):SLC20A2 (61%) > PDGFRA/B (12%) > PDGFB > XPR1 AR:MYORG (13%) > JAM2 | 顯性以 SLC20A2 最多 隱性以 MYORG 最常見 |
| TTR-FAP | 台灣:A97S >> I73V 非裔美籍:A122I | A97S 臨床特點: • Sensory polyneuropathy • 自律神經失調 (~70%) • Heart failure • Neuropathic pain ~60% |
| bv-FTD (病理/基因) | TDP-43 (50%) > Tau (40%) > FUS (10%) | 前額顳葉失智症常見病理蛋白沉積分布 |
| 肌張力不全 (Dystonia, 台灣) | SGCE > TH > GCH1 = PRRT2 = CACNA1B > PLA2G6 = PINK1 > Parkin | – |
| 家族性帕金森氏症 (PD) | 最常見 AD: LRRK2 最常見 AR: PARKIN | LRRK2 常見突變: 全球最常見:G2019S 台灣/亞洲 Risk gene:G2385R, R1628P |
| 家族性漸凍症 (ALS, 全球) | Familial: C9orf72 > SOD1 > TARDBP / FUS Sporadic: C9ORF72 > TARDBP / FUS / SOD1 | 全球以 C9ORF72 重複擴增最常見 |
| 家族性漸凍症 (ALS, 台灣) | SOD1 > TARDBP > C9orf72 > FUS | 台灣與亞洲族群以 SOD1 與 TARDBP 為主 |
| 家族性阿茲海默症 (FAD) | AD3 (PSEN1, ~80%) > AD1 (APP) > AD4 (PSEN2) | EOAD 風險基因: NOTCH3, SORL1, TREM2 AD2: APOE4 (風險因子) |
| 家族性庫賈氏病 (Prion / fCJD) | 歐洲: E200K > V210I > D178N (FFI) > P102L 日本: V180I > P102L > E200K | • D178N: 致死性家族性失眠症 (FFI) 或 CJD • P102L: GSS 症候群 (Gerstmann-Sträussler-Scheinker) |
常見疾病與主題考點
| 疾病 / 主題 | 基因 / 突變位點 / 蛋白 |
| FHM | 1: CACNA1A 2: ATP1A2 3: SCN1A |
| Paroxysmal dyskinesia | PED: SLC2A1 (GLUT1 DS) PKD: PRRT2 PNKD: MR1 |
| MS | HLA-DRB1*1501, HLA-A3, B7, Dw2, DR2 IL-2 and IL7 receptor loci |
| Mitochondrial disease | MERRF: 8344 A -> G mutation (t-RNA-Lys); 8356 and 8366 tRNA-Leu gene MELAS: tRNA-Leu 3243 A -> G mutation; tRNA-Val, tRNA-Cys, ND5 of complex 1, cytochrome b of complex III Mitochondrial myopathy, lactic acidosis and sideroblastic anemia: YARS2, PUS1 |
| CACNA1A | SCA6, FHM1, EA2 |
| Migraine | Familial MA: TRESK (KCNK18) FASPS2: CSNK1D HM: PRRT2 CHARIOT / RVCL: TREX1 CADASIL: NOTCH3 HIHRATL: COL4A1 |
| CJD (Familial CJD) | European: E200K > V210I > D178N (FFI) > P102L Japan: V801I > P102L > E200K FFI or CJD: D178N GSS: P102L |
| 很像的基因系列 | ATP2A1 = Brody’s syndrome ATP1A2 = FHM2 ATP1A3 = C (CAPOS) .A (Alternating hemiplegia of childhood) . R (RDP) SLC2A1 = GLUT1 deficiency syndrome SLC52A2, SLC52A3: Fazio-Londe syndrome |
| CANVAS | RFC1 mutation |
| PLS | 和 ALS 不同的 Entity,No family history 只有很少人有 C9orf72 mutation (1.3% PLS) Juvenile PLS: ALS2 / ERLIN2 |
| ALS / FTD | ALS: TDP-43, SOD1, FUS FTD: Tau, PGRN, VCP, CHMP2B • FTD-ALS: C9orf72, UBQLN2 |
| Familial AD | AD1: APP AD2: APOE4 AD3: PSEN1 AD4: PSEN2 |
| EOAD | NOTCH3 SORL1 TREM2 |
| FTD | 三大基因:GRN (Chr 17)、MAPT (Chr 17)、C9orf72 (Chr 9) 其他基因(少見):TBK1, VCP (Chr 9), CHMP2B (Chr 3), FUS (Chr 16), TARDBP (Chr 1) |
| DLB | Alpha-synuclein deposition +/- AD pathology Down-regulation: UCHL-1, PRKN Up-regulation: SNCAIP Common and rare variant: APOE, SNCA, GBA, TMEM175, BIN1 Other pathogenic variants: PSEN2, CHMP2B, PRKN, SQSTM1 |
| DM | DM1: DMPK (CTG repeats) DM2: CNBP (CCTG repeats) |
很像的基因系列
ATPXXX, SLCXXX
- ATP2A1 = Brody’s syndrome
- ATP1A2 = FHM2
- ATP1A3 = C (CAPOS) .A (Alternating hemiplegia of childhood) . R (RDP)
- SLC2A1 = GLUT1 deficiency syndrome
- SLC52A2, SLC52A3 = Fazio-Londe syndrome
| 基因名稱 | 相關疾病 / 症候群 | 臨床核心特點 |
| ATP1A2 | 家族性偏癱偏頭痛 2 型 (FHM2) | AD 遺傳,伴隨偏癱的偏頭痛 |
| ATP1A3 | C.A.R. 症候群 • CAPOS syndrome • AHC (Alternating hemiplegia of childhood) • RDP (Rapid-onset dystonia-parkinsonism) | 幼年發作偏癱、肌張力不全、小腦症候群等 |
| ATP2A1 | Brody’s disease | 肌肉運動後僵直、無痛性肌肉痙攣 |
| SLC2A1 (GLUT1) | • GLUT1 缺乏症候群 (GLUT1 DS) • 發作性運動誘發性肌張力異常 (PED/DYT18) | 腦脊髓液葡萄糖過低、癲癇、運動誘發動作障礙 |
CACNA1A 相關疾病
- SCA6:純小腦萎縮症(CAG 擴增)
- FHM1:家族性偏癱偏頭痛 1 型(點突變)
- EA2:發作性共濟失調 2 型 (Episodic Ataxia type 2)
- Absence Seizure / 小腦共濟失調
核苷酸重複擴增疾病 (Repeat Expansion)
Polyglutamine (PolyQ) 疾病
| 疾病名稱 | 染色體位置 | 突變基因 | 蛋白質產物 | 備註 |
| SCA1 | 6p22 | ATXN1 | Ataxin-1 | ADCA1 |
| SCA2 | 12q24 | ATXN2 | Ataxin-2 | Slow saccades |
| SCA3 (MJD) | 14q32 | ATXN3 | Ataxin-3 | 台灣最常見 SCA,突眼、肌萎縮 |
| SCA6 | 19q13 | CACNA1A | alpha 1A次單元 | ADCA3 (純小腦型,進程慢) |
| SCA7 | 3p14 | ATXN7 | Ataxin-7 | ADCA2 (伴隨視網膜黃斑部病變) |
| SCA17 | 6q27 | TBP | TATA-binding protein | HDL4,表現類似 HD |
| DRPLA | 12p13 | ATN1 | Atrophin-1 | 齒狀核紅核蒼白球路易體萎縮 |
| HD (亨丁頓舞蹈症) | 4p16.3 | HTT | Huntingtin | 舞蹈症、精神精神症狀、失智 |
| SBMA (甘迺迪氏症) | Xq12 | AR | Androgen Receptor | 伴性隱性 (XR),下運動神經元退化+男性女乳 |
非編碼區重複擴增疾病 (Non-Coding Repeat Expansions)
| 疾病名稱 | Repeats | 基因 | 臨床備註 |
| DM1 | CTG | DMPK | 白內障、心律不整 |
| DM2 | CCTG | CNBP (ZNF9) | 近端為主 |
| FRAXA / FXTAS | CGG | FMR1 | |
| NIID | CGG | NOTCH2NLC | |
| FTD / ALS | GGGGCC | C9orf72 | FTD與漸凍症最常見顯性基因 |
| FRDA | GAA | FXN (Frataxin) | AR,小腦萎縮+心肌病變+脊柱側彎 |
| HDL2 | CTG | JPH3 | 非洲裔最常見 HD Phenocopy |
| SCA8 | CTG / CAG | ATXN8OS / ATXN8 | 雙向轉錄擴增 |
| SCA10 | ATTCT | ATXN10 | Ataxia + 癲癇 |
| SCA12 | CAG | PPP2R2B | Upper limbs tremor |
| SCA31 / SCA37 | TGGAA / ATTTT | BEAN1 / DAB1 | 晚發型 |
| SCA36 | GGCCTG | NOP56 | 伴隨舌肌萎縮 (Asidan ataxia) |
